Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3FQ13275 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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