Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3BQ13214 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SEMA3BQ13214 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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