Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB40BQ12829 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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