Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TWF1Q12792 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TWF1Q12792 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TWF1Q12792 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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