Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms