Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDR1Q08345 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms