Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC3A1Q07837 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms