Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms