Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF11Q05519 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF11Q05519 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms