Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNT1Q02742 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms