Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX6P78412 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms