Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HBBP68871 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HBBP68871 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HBBP68871 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HBBP68871 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms