Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM4P67936 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM4P67936 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM4P67936 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPM4P67936 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM4P67936 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM4P67936 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM4P67936 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM4P67936 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPM4P67936 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms