Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL3P58872 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms