Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms