Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP3M2P53677 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms