Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX2P52951 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX2P52951 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX2P52951 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GBX2P52951 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms