Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF6P49848 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF6P49848 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF6P49848 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms