Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms