Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35P42766 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms