Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM23P36406 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM23P36406 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms