Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJC1P36383 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms