Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASQ1P31415 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
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CASQ1P31415 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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