Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSPOP30536 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSPOP30536 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms