Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMBRP28336 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NMBRP28336 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMBRP28336 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NMBRP28336 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NMBRP28336 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NMBRP28336 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMBRP28336 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMBRP28336 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms