Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS6KB1P23443 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms