Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VEGFAP15692 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms