Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DEFA4P12838 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms