Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTMAP06454 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTMAP06454 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTMAP06454 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTMAP06454 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms