Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTA1P02549 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTA1P02549 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms