Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-AP01891 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-AP01891 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms