Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE8BO95263 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms