Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOX15O60248 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX15O60248 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms