Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms