Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXO3O43524 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXO3O43524 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms