Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA3O43365 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms