Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZBTB39O15060 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBTB39O15060 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms