Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DGG1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DGG1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DGG1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DGG1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DGG1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DGG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DGG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DGG1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DGG1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DGG1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms