Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTMR11A4FU01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTMR11A4FU01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms