Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC144AA2RUR9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms