Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYCE3A1L190 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCE3A1L190 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms