Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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