Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX49Q9Y6V7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX49Q9Y6V7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms