Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SHOC2Q9UQ13 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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