Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGSF9BQ9UPX0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms