Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IQSEC3Q9UPP2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQSEC3Q9UPP2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms