Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms