Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
MSRB1Q9NZV6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MSRB1Q9NZV6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms