Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms