Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PODXL2Q9NZ53 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PODXL2Q9NZ53 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms